广东祈福医院成立之初即设有心血管内科，经多年的发展，目前已设有3个病区：普通房病一区、二区及CCU病房，共有102张病床；CCU病房设有14张床位，配有先进的监护及治疗设备；同时拥有心脏介入中心及心功能室。近年科室各项业务快速发展，年门诊量超过5万人次，出院病人2500-3000，心血管介入手术超1000例。是医院的龙头科室，医护人员配备齐全，诊疗规范，技术精湛，是广东省中医药局重点建设专科。
以中西医结合为特色，人才梯队建设合理，科室医生80%均有硕士以上学历；学科带头人洪长江主任系2017年从原广州军区总医院引进，是军、地知名心血管病专家；在洪主任的带领下科室各项业务快速发展，特别是心血管介入诊疗，数量及质量均达到市级先进水平。在冠心病介入方面，急性心肌梗死的救治达到国内先进水平；2016年成立了胸痛中心，在2018年分别通过了广东省及国家认证，是广州市第一家通过认证的非公立医院。
心血管介入诊疗是心血管内科核心技术，现以冠脉介入为龙头，电生理、起搏器植入，外周血管介入，先心病介入同步发展。
除国家标准版胸痛中心外，还成立了房颤中心，拟成立高血压中心、心衰中心、心脏康复中心。
